PP. At-Taqwa memiliki asrama santri yang memadahi dan sangat nyaman, meliputi asrama santri putra dan santri putri yang terpisah dan dibina serta didampingi oleh asatidz dan asatidzah di masing-masing asrama. Ruang asrama 15m dengan fasilitas kamar mandi dalam, kipas baling-baling, kasur busa persegi panjang yang empuk.

Gedung sekolah yang representatif, nyaman dan fasilitas kelas yang memadahi sesuai dengan kebutuhan kelas modern.

Masjid yang memiliki ukuran 25m x 25m dengan sentuhan klasik yang menawan, bisa menampung 1000 jamaah, dilengkapi AC yang sejuk, membuat santri berlama-lama dengan Al-Qur'an  untuk menghafal dan murojaah.

Pondok Pesantren At-Taqwa Muhammadiyah Kranji juga sangat peduli dengan kebutuhan santri yang ingin rileks dan tenang untuk menghafal Al-Qur'an diluar asrama dengan udara sejuk dan iklim alami yang masih rindang dengan banyak pepohonan.

Memiliki 6 kamar di masing gedung dengan desain minimalis. Mengutamakan kebersihan demi menjaga kesehatan para santri.